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北京大學(xué)分子生態(tài)實驗室管理系統(tǒng)建設(shè)方案

2019-07-11 16:25


北京大學(xué)分子生態(tài)實驗室隸屬于北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,從事物種的群體遺傳結(jié)構(gòu)、生物地理歷史、種群動態(tài)歷史及景觀因子對基因流的影響展開分析研究,涵蓋演化基因組學(xué)生物信息學(xué)計算,生物樣品資源庫規(guī)范管理,分子生態(tài)學(xué)研究,古代DNA基因組分析。實驗室目前有多名博士和碩士研究生人員。

為了使實驗操作流程更加標(biāo)準(zhǔn)化、提高試驗研究的效率和質(zhì)量,并確保實驗室研究成果的完整性、真實性和可靠性,并保障實驗室人員的安全。該實驗室需要建設(shè)一套規(guī)范化智能化的實驗室管理系統(tǒng),并具備針對:實驗室預(yù)約、實驗室儀器設(shè)備、實驗室樣品試劑、實驗室人員等方面進(jìn)行管理功能。?

一、預(yù)約申請功能:

第一步:提交申請

用于使用人向?qū)嶒炇夜芾砣?、實驗室?fù)責(zé)人等提交書面申請,說明所在院系、課題組、項目名稱,擬開展的實驗類型和時間范圍,以及是否使用危險化學(xué)品和自帶設(shè)備等。

? 使用人填寫申請表格,,提交后管理端顯示待審批,并發(fā)送郵件給實驗室管理人、實驗室負(fù)責(zé)人和使用人課題組負(fù)責(zé)人。

? 申請人成為“使用負(fù)責(zé)人”用戶;使用人課題組負(fù)責(zé)人成為“使用人課題組負(fù)責(zé)人”用戶;使用人成為“使用人”用戶

? 實驗室管理人和實驗室負(fù)責(zé)人通過郵件鏈接至系統(tǒng)中的批準(zhǔn)界面。

? 批準(zhǔn)后使用人收到批準(zhǔn)通過提示。

第二步:培訓(xùn)和考核

? 使用人在線觀看《北京大學(xué)分子生態(tài)實驗室公共實驗平臺管理規(guī)定》和培訓(xùn)視頻(待制作)。

? 觀看完畢進(jìn)入考核頁面(待制作),接受考核。

? 提交后發(fā)送閱卷通知給實驗室管理人,管理人打分。

? 得分超過80分為考核通過,進(jìn)入下一步。低于80分為考核未通過,重新回到培訓(xùn)部分。

第三步:簽署實驗室使用責(zé)任書

? 考核通過在線打印實驗室使用責(zé)任書(待制作)。

? 書面簽字后由使用人手機掃描上傳。

第四步:使用預(yù)約

用于簽署過實驗室使用責(zé)任書的使用負(fù)責(zé)人和使用人,在使用前預(yù)約實驗室和使用時間。至少提前2工作日提交預(yù)約,最多可預(yù)約兩周(預(yù)約第一日到最后一日間不超過14天)。

? 共有4個實驗室,注明使用到的實驗室:擴增配液室、綜合操作室、樣品制備室、擴增及產(chǎn)物分析室。

? 日歷形式顯示,預(yù)約時段以半天為單位,可設(shè)置為:8:00-12:00;13:00-17:30;18:00-22:00。

? 預(yù)約控制:1. 每個實驗室每個使用時段有使用人數(shù)上限,超過則不可預(yù)約。擴增配液室2人、綜合操作室3人、樣品制備室2人、擴增及產(chǎn)物分析室2人。2. 同一天內(nèi)只能預(yù)約先進(jìn)擴增配液室,再進(jìn)其他實驗室,反之不能預(yù)約。3. 同一時段如果包含擴增配液室,則不能同時預(yù)約樣品制備室和擴增及產(chǎn)物分析室。

? 預(yù)約提交后管理端顯示待審批,并發(fā)送郵件給實驗室管理人。

? 實驗室管理人通過郵件鏈接至系統(tǒng)中的批準(zhǔn)界面。

? 批準(zhǔn)后使用人收到批準(zhǔn)通過提示。

? 預(yù)約使用擴增配液室的使用人在使用擴增配液室的前一日收到提示:“必須提前一日洗澡洗頭,更換干凈衣服。使用當(dāng)日進(jìn)入擴增配液室前不得進(jìn)入非潔凈區(qū)(樣品制備室、擴增及產(chǎn)物分析室、樣本庫)。預(yù)約周末使用的使用人前一日收到提示:“周末使用實驗室需特別注意基本使用和實驗操作的安全性,離開實驗室前按照”自檢提示“進(jìn)行安全檢查。

二、樣品管理功能

1.?樣本采集申請

? 采樣操作指南、視頻和野外采樣信息表在系統(tǒng)中獲得

? 樣本入庫申請人填寫樣本入庫申請,包括信息:采集人、采樣地區(qū)、采樣日期、樣品數(shù)量、運送方式等,附件野外采樣信息表(按照已有的統(tǒng)一模板,包括字段:網(wǎng)格編號、樣線地點、參與調(diào)查人、調(diào)查負(fù)責(zé)人、日期、時間、GPS編號、野外樣品編號、經(jīng)度、緯度、海拔、地面基質(zhì)、生境類型、崎嶇度、地形、樣本類型、物種(野外判斷)、樣本數(shù)量、樣本新舊、是否在刨坑上、照片編號等,表格或數(shù)據(jù)庫格式)

? 申請?zhí)峤缓蠊芾矶孙@示待審批,并發(fā)送郵件給實驗室管理人、樣本庫管理人。

? 實驗室管理人和樣本庫管理人通過郵件鏈接至系統(tǒng)中的批準(zhǔn)界面。

? 批準(zhǔn)后樣本采集人收到申請獲批的提示,建立一個新樣本入庫任務(wù),信息和野外采樣信息表接入。

? 樣本入庫后入庫任務(wù)完成,并自動提示樣本采集人“樣本已接收入庫。入庫樣本數(shù)為XX個,XX條采樣信息未收到對應(yīng)樣本“。

2.?新樣品入庫

用于新采集的樣本首次入庫

? 打開一個新樣品入庫任務(wù),打開野外采樣信息表。對實際收到樣品的野外編號進(jìn)行掃碼或輸入

? 成功對應(yīng)到野外采樣信息表中的野外編號,則新建一條入庫記錄。

????? 打印實驗室編號標(biāo)簽,貼上后掃碼將實驗室編號錄入,再掃“樣品袋編號”和“冰箱編號”將新樣本定位。

????? 標(biāo)簽貼于50mL離心管上,需能抵抗-80℃低溫,質(zhì)地可參考兄弟(brother)標(biāo)簽機色帶。

????? 自動檢查入庫記錄中的經(jīng)度、緯度兩個字段。如填寫無誤,則“經(jīng)緯度來源”字段處填“GPS”。

????? 如缺填或填寫有誤,彈出提示“需要補充填寫經(jīng)緯度”,彈出“參考經(jīng)緯度”窗口,手動填寫“參考經(jīng)緯度”填入,同時“經(jīng)緯度來源”字段處自動填寫“Refer”。

????? 確認(rèn)該條入庫記錄錄入完畢。

? 無法對應(yīng)野外采樣信息表中野外編號的樣品,自動新建一條入庫記錄,字段同野外采樣信息表,手動輸入采樣信息。打印實驗室編號標(biāo)簽,貼上后掃碼將實驗室編號錄入,再掃“樣品袋編號”和“冰箱編號”將新樣本定位。確認(rèn)該條入庫記錄錄入完畢。

? 允許同一編號的樣品多于一份的情況,識別到相同野外編號時直接彈出同一個樣品的入庫窗口,數(shù)量加1,并指示該樣品應(yīng)該存放的位置。

? 接收樣品全部入庫后確定入庫任務(wù)完成。沒有實際樣品對應(yīng)到的野外采樣信息表信息,提示“是否刪除”,確認(rèn)刪除后清空記錄。

? 提示樣本采集人“樣本已接收入庫。入庫樣本數(shù)為XX個,XX條采樣信息未收到對應(yīng)樣本“。

3.?樣品領(lǐng)用(出回庫)

? 申請出庫

????? 從實驗安排和實驗申請中計劃樣品清單直接鏈接到出庫申請,填寫使用人、出庫時間、歸還時間等

????? 出庫申請頁面,填寫出庫目的、領(lǐng)用負(fù)責(zé)人、出庫樣品清單(樣本庫中查詢時間、地點、物種、樣品在庫情況等后生成)、出庫時間、歸還時間等

????? 申請?zhí)峤缓蠊芾矶孙@示待審批,并發(fā)送郵件給實驗室管理人、樣本庫管理人。

????? 實驗室管理人和樣本庫管理人通過郵件鏈接至系統(tǒng)中的批準(zhǔn)界面。

????? 批準(zhǔn)后樣本采集人收到申請獲批的提示,并獲得出庫樣品信息表(包括信息:野外編號、實驗室編號、時間、地點、經(jīng)緯度、物種、在庫情況、樣品定位、出庫時間、出庫批次、項目名稱、經(jīng)手人、負(fù)責(zé)人等)和學(xué)術(shù)發(fā)表屬名人、致謝人名單。同時建立一個樣本出庫任務(wù)。

? 掃碼出庫。找到樣品后掃碼記錄出庫,相應(yīng)的在庫情況數(shù)量減一,“出庫情況”顯示1。

? 回庫提醒,出庫后每半月提醒領(lǐng)用負(fù)責(zé)人進(jìn)行樣品回庫

? 回庫登記,逐一樣品掃碼記錄回庫,相應(yīng)在庫情況數(shù)量加一?;貛旖Y(jié)束提醒

? 回庫登記時,同時進(jìn)行樣品用完的登記。

三、LIMS系統(tǒng)整體功能需求


序號模塊功能備注
1系統(tǒng)管理人員管理人員基礎(chǔ)信息錄入數(shù)據(jù)庫
角色管理擁有系統(tǒng)功能的角色維護(hù)
用戶管理擁有系統(tǒng)操作權(quán)限的用戶,如實驗室管理人員及系統(tǒng)管理人員等
授權(quán)管理給系統(tǒng)用戶根據(jù)職責(zé)或者角色進(jìn)行操作授權(quán)
實驗室管理對實驗室相關(guān)信息進(jìn)行登記,相當(dāng)于系統(tǒng)部分管理
日志管理記錄所有用戶操作詳情
2系統(tǒng)應(yīng)用
增加引物列表
字典管理方便系統(tǒng)用戶進(jìn)行選擇的各類屬性
資金來源采購設(shè)備或者耗材時的資金來源
設(shè)備分類針對學(xué)員設(shè)備屬性進(jìn)行分類,便于設(shè)備資產(chǎn)的歸類和統(tǒng)計
耗材分類針對耗材信息進(jìn)行歸類,便于耗材的統(tǒng)計和分析
供應(yīng)商管理購買耗材或者設(shè)備時,便于選擇和參照
3設(shè)備儀器設(shè)備儀器信息實驗室儀器設(shè)備信息、定期校準(zhǔn)、正常、維修、生命周期提醒等管理
4預(yù)約管理
實驗室使用申請和預(yù)約管理
預(yù)約過程注冊登錄、預(yù)約申請、審核通過,預(yù)約違規(guī)記錄,暫停預(yù)約
5實驗安排實驗排表實驗預(yù)約安排、實驗計劃
6樣品管理臺帳管理樣本的定義、樣本的分類、接收時的性狀、檢測實驗前期等樣本管理
日常事務(wù)樣本的接收、樣本實驗的領(lǐng)用、中間產(chǎn)物的再入庫、樣品清點等
7實驗管理測序?qū)嶒灩芾?/span>記錄實驗人員、時間、試劑、過程、實驗結(jié)果等
8實驗報告實驗結(jié)果生成實驗報告查詢、存檔、上傳、打印
9耗材采購申請耗材采購申請針對設(shè)備采購申請進(jìn)行審核,并在線審批
耗材采購審核針對設(shè)備采購申請進(jìn)行審核,并在線審批
耗材采購根據(jù)采購計劃匯總、根據(jù)供應(yīng)商進(jìn)行分組和采購
耗材采購單打印對采購單進(jìn)行打印和查看
10耗材管理溯源管理(條形碼)登記耗材信息,并同時登記耗材條形碼,方便耗材的入庫和出庫,根據(jù)條形碼可以及時有針對性的采購
(包含試劑)危險品管理對危險耗材進(jìn)行屬性登記并進(jìn)行有效提醒和監(jiān)控,可以確保存儲安全和使用安全

自管庫管理,專柜、專管人、領(lǐng)用信息等

耗材庫存預(yù)警根據(jù)每個耗材的庫存下限進(jìn)行設(shè)置,并在臨界值進(jìn)行預(yù)警,確保庫存量

耗材入庫根據(jù)采購單進(jìn)行入庫,采用掃碼入庫,并形成庫存;

液體測量通過電子秤進(jìn)行液體測量,并登記測量信息和打印條形碼標(biāo)簽

液體領(lǐng)取(退換)掃碼領(lǐng)取,更新液體容量;如有剩余,再掃碼退換;液體領(lǐng)取和其他耗材領(lǐng)取類似,只是中間多了液體測量和分拆的步驟

耗材領(lǐng)取掃碼領(lǐng)取,出庫更新庫存

庫存管理對各類耗材庫存數(shù)量進(jìn)行查看

庫存盤點按低資耐耗、文化用品、日常用品分類盤點,確保庫存平衡
12物資管理庫房盤點儀器設(shè)備等出入庫管理等
14資訊通知資訊發(fā)布發(fā)布學(xué)院信息,通過信息欄可以快速閱讀和了解學(xué)院信息
通知公告通過公告可以發(fā)布學(xué)院通知信息及系統(tǒng)信息登
消息提醒消息推送、提醒、警示等
15統(tǒng)計分析設(shè)備統(tǒng)計對設(shè)備類型情況及分布情況等進(jìn)行多類型統(tǒng)計
設(shè)備詳情查看設(shè)備檔案信息,及其所有輔助信息,好比設(shè)備履歷
耗材統(tǒng)計統(tǒng)計現(xiàn)有耗材數(shù)量統(tǒng)計及已消耗數(shù)量統(tǒng)計等
設(shè)備狀態(tài)分析根據(jù)設(shè)備不同狀態(tài)了解資產(chǎn)現(xiàn)狀
耗材庫存統(tǒng)計根據(jù)按低資耐耗、文化用品、日常用品分類,即時了解耗材庫存情況,便于耗材的管理和采購等
16管理端內(nèi)部使用實驗室管理人員和實驗人員使用
17預(yù)約端客戶預(yù)約客戶可查看實驗預(yù)約、實驗結(jié)果等情況
18移動端小程序或APP基礎(chǔ)信息展示
19第三方系統(tǒng)可連接公司原有0A或ERP等其它系統(tǒng)


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